文章作者：林星帆
本文為重新編輯 2014/8 發表在晨晰統計部落格的文章，這裡、這裡與這裡
前言
健保資料庫簡介
本系列文章旨在讓讀者對於健保資料庫的資料結構有所瞭解，當我們知道健保資料庫各次資料庫分別有什麼變項之後，可以幫助我們著手進行研究設計，最後我將討論健保資料庫的優勢以及面臨到的挑戰。
首先我們要瞭解到健保資料庫主要目的是「報帳」，也就是各醫療院所要向中央健康保險局（健保局）申報費用的報帳系統，然而由於台灣 2300 萬人從民國 84 年到現今的資料量實在太大，因此為了方便使用，國家衛生研究院（國衛院）會將健保資料按照不同分類、對象、年代分別建立眾多的次資料庫，以下我們稍作介紹。
國衛院發行的健保資料庫結構頗為複雜，需要先瞭解各種資料來源，接著在瞭解國衛院資料加值服務所提供的資料組合，資料來源部分分成①基本資料檔、②原始資料檔；資料加值服務所提供的資料組合則包括①基本資料檔、②系統抽樣檔、③特定主題分檔，④抽樣歸人檔以及⑤特殊需求。
資料來源－基本資料檔
下表列出「基本資料」的各種資料庫，所謂基本資料的定義就是「全台灣的母群體資料」，且為每年重新發行一次，以下介紹幾個最常使用的基本資料檔（Registration files）的檔案。
承保資料檔（ID）
ID 檔堪稱是基本資料中最重要的檔案，該檔案會有全台灣 2300 萬人的最後一次在保狀況（在保中或已退保）。因為紀錄某人的最後一次在保狀態，以 2014 年來說，如果仍在保那我們就知道某人在 2014/12/31 時仍然存活，而如果 ID 檔顯示此人在 2014/7/30 已退保，我們就知道此人追蹤時間不會超過 2014/7/30，ID 檔重要之處是可以計算病人的追蹤時間。
醫事機構基本資料檔（HOSB）
裡頭會有全台灣所有醫療院所的基本資料，例如評鑑等級、機構所在地的郵遞區號等等。評鑑等級可以用來判斷病人是在何種評鑑等級的醫院就醫，包括醫學中心、區域醫院、縣市醫院、診所；郵遞區號則是可以知道此機構的地理位置，例如我們可以分成北區、中區、南區或東區。
重大傷病證明明細檔（HV檔）
HV 則是用來確認病人是否有某種重大傷病，最常見的就是洗腎、先天性疾病（例如先天性心臟病）、癌症等等，會登記到 HV 檔的病人由於看病都是免費的，因此用 HV 來確認重大傷病是非常嚴謹的。
藥品主檔（DRUG）
DRUG 檔則是藥物總檔，會列出「累計」到目前為止健保局曾經批准核保的藥物，由於是累計檔，通常用最新一年的檔案即可，舉 2011 為例，DRUG 檔中約有 3 萬種藥物。不過通常會使用到 DRUG 檔就是涉及到藥物研究，一般藥物研究在健保資料庫會是難度較高的研究。
資料來源－原始資料檔
接著是原始資料檔，相較於基本資料檔，也就是無法一次拿到全台灣 2300 萬人的所有資料，而是要按照申請案的類型，看是「系統抽樣檔」或是「特殊需求申請」而提供某種特定個案的資料。
資料來源為國衛院網站
住院醫療費用清單明細檔（DD）
DD 檔記載了每一個病人當次住院的各種費用明細、主次診斷（ICD-9）及主次手術/處置，DD 檔的資料單位（unit）是每一次住院，但如果此人住院超過 30 天，醫療院所每 30 天要向健保局申報一次，若此人住院 50 天，則在 DD 檔則會有 2 次紀錄，因此要作「歸戶」的動作。
在研究健保資料庫時，DD 檔是非常重要的檔案，因為可由 DD 檔判斷出非常多的醫療細節，至少包括：住院日期與出院日期（可算住院天數）、在院是否死亡（由轉歸代碼判斷）、本次出院診斷為何（1 個主診斷、4 個次診斷）、本次出院手術/處置為何（1 個主、4 個次）、醫療總費用及細項（例如手術費、藥費等）。
住院醫療費用醫令清單明細檔（DO）
DD 檔是以住院為單位，其費用大都是分類過後的總費用，例如病人同一次住院期間可能做過好幾種手術，但 DD 檔只會有這一次住院的所有手術加總的費用；藥費也是一樣，DD 檔只提供本次住院期間所有藥費的加總。
DO 檔則是每一次住院的所有明細，統稱為醫令（Order），舉凡任何一項瑣碎的費用皆需記載在醫令檔，例如病人住院期間可能動了三種不同的手術，那麼在醫令檔中就可以找到這 3 筆醫令的資料，包括單價、數量及總價。
DO 檔的資料單位是醫令，有可能一次住院就申報了數百筆至數千筆的醫令，例如食鹽水、護理人員照護費、醫師診察費、A 手術的手術費、B 手術的手術費、加護病房費、各式各樣的耗材費，全部都詳細地記載在醫令檔之中。
醫令檔還有一個額外的用處，即由於 DD 檔的手術/處置碼只有 5 個（1 個主+4 個次），有些嚴重的病人在住院期間可能會作了很多處置或手術，而DD 檔只能提供五個，此時可利用 DO 檔來判斷各種處置或手術。
門診處方及治療明細檔（CD）
CD 檔記載了每一個病人當次門診的各種費用明細、主次診斷及主次手術/處置，CD 檔的資料單位（unit）是每一次門診。
一般用 CD 檔較常擷取的內容為診斷碼（3 個診斷，沒分主或次）、手術/處置碼（僅有 1 個主手術代碼）、醫療總費用及細項（例如藥費、診察費等）。
值得注意的是，門診也有可能會有手術，例如疝氣手術、清創手術，因此 CD 檔有提供一個手術/處置碼。
門診處方醫令明細檔（OO）
相較於 DO 檔是住院醫令，OO 檔則是記錄本次門診所開立的醫令，例如藥物明細，包括單價、數量及總價。
特約藥局處方及調劑明細檔（GD）與特約藥局處方醫令檔（GO）
GD 跟 GO 則是「慢性病連續處方箋」的記錄檔，慢性病例如糖尿病、高血壓或高血脂等，由於罹患慢性病的病人通常病情比較穩定，不需要每個月為了拿藥又要回到醫院排隊、看診及批價，因此可以直接到一般藥局或診所領藥。
例如以糖尿病為例，就是每三個月要領一次藥順便抽血檢查。
通常是作慢性病的藥物研究才會使用到 GD 跟 GO 檔，關於慢性病的涵蓋範圍與規定可參考健保局網站。
資料加值服務所提供的資料組合
瞭解了「資料來源」之後，我們要明白到一件事情，由於健保的原始資料過於龐大，對研究者而言非常難以使用，因此國衛院會將健保局提供的資料建置為各類加值資料檔案，以利研究者使用。
主要分成兩種：「制式光碟片」與「特殊需求申請」，其中制式光碟片又包括了①系統抽樣檔、②特定主題分檔及③抽樣歸人檔，以下將稍作說明。
基本資料檔
如國衛院網站所說明：醫事機構病床主檔（BED）、醫事機構診療科別明細檔（DETA）、醫事機構基本資料檔（HOSB）、專科醫師證書主檔（DOC）、醫事人員基本資料檔（PER）、重大傷病證明明細檔（HV），以及門診、住院費用總表等九類資料檔，製成一片檔光碟發行。
承保檔雖屬基本資料（registry），因其檔案較大，另以「特定主題分檔」發行。
每一年度都會有其基本資料檔，因此如果研究時間涵蓋五年，那一般都會購買這五年的基本資料檔，共五片光碟。
系統抽樣檔
系統抽樣檔有兩組資料，第一組是 DD 跟 DO 的系統抽樣，以該年度 1/20 的比例抽樣；第二組是 CD 與 OO 的系統抽樣，以該年度 1/500 的比例抽樣。
但由於此類系統抽樣無法將同一個人的資料作「歸人」的處理，也就是說，若我們同時申請兩年的 DD/DO 系統抽樣檔，我們也無法辨識同一個人在這兩年是否皆有資料，因此一般研究比較少使用這類檔案。
特定主題分檔
特定主題分檔的檔案非常多種，但依照個人使用經驗，主要常用的還是ID（承保檔）。
ID 承保檔雖然算是基本資料檔，但由於資料過於龐大，因為放了 2300 萬人的承保資料，因此另外以特定主題分檔的方式發行。
常見的特定主題分檔（Data subsets）的檔案可參考下表。
常見的特定主題分檔（Data subsets）的檔案可參考下表。
資料來源為國衛院網站
歸人抽樣檔－承保抽樣歸人檔
承保抽樣歸人檔（LHID）是一般研究者進行健保資料庫最常用的套裝組合，又稱之為「百萬歸人檔」，以 LHID2000 為例，就是西元 2000 年所有在保的身份證字號（ID）中，隨機抽取 100 萬個 ID，並且擷取每人各年所有就醫申報資料（包括門診 CD/OO、住院 DD/DO 及特約藥局 GD/GO），製成承保抽樣歸人檔。
目前一共有 LHID2000、LHID2005 及 LHID2010 三套百萬歸人檔，不過目前比較少用 LHID2010 作研究，因為以 2010 在保作抽樣，若以前瞻性研究而言（Prospective study），其追蹤期可能不到 4 年（以目前 2014 年而言），因此目前通常以 LHID2000 及 LHID2005 較常見。
百萬歸人檔是作縱貫研究非常強大的一組資料，以 LHID2000 為例，我們可以有 100 萬人從 1996～2012（更新至2013年底後即不再更新）這將近 20 年期間的所有就醫資料，包括住院、門診及慢性連續處方箋（特約藥局）的所有資料，因此非常適合作前瞻性研究或縱貫型研究。
不過百萬歸人檔有個限制，即不適合研究罕見疾病或罕見的暴露因子，若某疾病的每年發生率僅 10 萬分之 1，以全台灣 2300 萬人來說，每年平均只有 230 人發病，若再除以 23 倍（100 萬人除以 2300 萬人），則每年僅有 10 個病例，這樣的病例數恐怕不足以作有效的統計分析。
除了百萬歸人檔，國衛院還提供了「糖尿病人抽樣歸人檔」，每年從新增的糖尿病患者中隨機抽取 12 萬人，一樣可擷取 1996～2012（更新至 2013 年底後即不再更新）的所有就醫資料。每年的 12 萬人皆分成 3 組發行，每一組包括 4 萬人。
特殊需求申請
「特殊需求」申請的意思是向國衛院申請某些條件的病人資料，通常都是符合某些條件、診斷、處置之下的病人。
例如我們欲研究先天性心臟病（Congenital heart disease, CHD），但是由於人數稀少因此不適合用百萬歸人檔來研究，此時就可向國衛院申請特殊需求，例如申請所有符合先天性心臟病（ICD-9：740–759）病人從 1996～2012（年份可自己選擇）期間的所有就醫資料，這等於是拿到全台灣所有 CHD 病人的就醫資料，也是非常強大的資料型態。
特殊需求內容包括門診處方及治療明細檔（CD）、門診處方醫令明細檔（OO）、住院醫療費用清單明細檔（DD）、住院醫療費用醫令清單明細檔（DO）、特約藥局處方及調劑明細檔（GD）、特約藥局處方醫令檔（GO）、物理治療所調劑檔（GDD）、物理治療所醫令檔（GOO）等 8 個檔案，可以不用一次申請全部檔案，例如可以只申請 DD 跟 DO，等於是住院歸人檔的意思。
